Einen der beiden zu "mergenden" Kanäle muss man global festlegen. Das macht man im SETUP-Mode über die Selektion des Control-Port. Den zweiten zu "mergenden" Kanal kann man individuell für jedes Programm festlegen. Dazu im IN-Mode auf die Taste 10 drücken (mit Merge beschriftet), dann den Kanal wählen. Übrigens: blinkende LED zeigt den Control Port an, die leuchtende LED den Merge-Port.
EDIT: Eine Ergänzung: Wenn was nicht funktioniert wie erwartet, unbedingt schauen ob evtl. der Midi-Filter aktiviert ist.