So allgemein, wie die Frage gestellt ist, kann man nur eine Antwort geben: ja.
Du hast jetzt einen Datenstrom, der Video- und Audioinformationen enthält. Der nächste Schritt wird sein aus diesem einen Datenstrom zwei zu machen: je einen für Video und Audio. Der Fachmann spricht von Demultiplexen. Dann kann man die Audiospur beliebig bearbeiten. Danach werden Bild- und Toninformationen wieder zusammen gefügt, d.h. multiplext. Und danach hast du wieder den fertigen Film.
Soviel zur Theorie. Die Praxis sieht dann so aus, dass du erstmal feststellen musst, welches Dateiformat du vorliegen hast. Da hat "Klangraum" völlig recht. Danach kannst du schauen, ob es ein Tool gibt um dieses Format zu demuxen. Im Idealfall kann ein Videoeditor mit entsprechender Audioausstattung viele dieser Einzelschritte in einem Rutsch erledigen, aber dazu musst du erst wissen, ob dein Videofile irgendein Standard ist.
Was willst du mit der Audiospur denn überhaupt anfangen?